Factorii abiotici ai unui estuar sunt adâncimea apei, salinitatea, nutrienții, temperatura aerului și a apei, pH-ul apei, oxigenul dizolvat și turbiditatea sau tulburarea. Nutrienții sunt substanțe în apă ca azot și fosfor, disponibil organismelor ca hrană.
Un estuar este un ecosistem în care gura unui râu sau a unui fluviu întâlnește mareea oceanului. Un factor abiotic este o parte neventivă a unui ecosistem. Pentru a determina starea sănătății estuarelor, oamenii de știință monitorizează atât factorii abiotici, cât și lucrurile vii sau factorii biotici.
pH-ul măsoară aciditatea sau alcalinitatea. Valoarea pH-ului de 7 este neutră. Valorile mai mult de 7 sunt alcaline și mai puțin de 7 sunt acide. Dacă apa este prea acidă sau prea alcalină, unele tipuri de organisme nu se dezvoltă.Estuarele sunt un loc primar în ciclul nutrițional al naturii, care face ca multe elemente să fie disponibile organismelor ca hrană. Într-un estuar sănătos, elementele rămân în echilibru. Prea multă cantitate de azot, de exemplu, și numerele algelor pot exploda, pot utiliza exces de nutrienți, apoi mor și folosesc prea mult oxigen pe măsură ce se descompun. Atunci când algele consumă prea multă hrană și oxigen, acestea le pot refuza altor organisme. De asemenea, florile algelor determină creșterea pH-ului. Dacă floarea este severă, creșterea pH-ului poate distruge animalele acvatice.
Turbiditatea este o măsură a materiei suspendate în apă. Dacă apa este prea tulbure, lumina soarelui poate fi prea puțină sau deloc penetrantă pentru a hrăni plantele acvatice, pe care alte organisme le hrănesc și care îndeplinesc sarcina necesară
oxigenarea apei.
