Există trei moduri de a diferenția dintre canarele masculine și cele feminine: inspecția genitală, aspectul culorii și cântecul timpuriu. Breederul Sebastian Vallelunga consideră inspectarea unui canar matur sexual ca fiind o metodă practic lipsită de siguranță, bărbatul având un pseudo-penis care iese din ventilație, în timp ce o femeie are o cupolă rotundă care iese în afară de aerisire. Femelele gata pentru a avea rase au o burtă uniformă, torpilă, care se îngustează la un capăt.
Indicatia cea mai evidenta si cea mai fiabila a sexului este daca canarul isi pune sau nu un ou. Unii crescători preferă să separe sexul mai devreme pentru a promova o dezvoltare mai bună a melodiilor în rândul bărbaților, chiar înainte de puii de pui. Examinarea cântecului timpuriu și analizarea bazată pe culoare sunt instrumente utile.
Cântecul timpuriu al canarului, cunoscut sub numele de sub-cântec, este un trilog viu în care gâtul bărbatului se umflă, reflectând comportamentul adulților. În următoarea fază de învățare a cântecelor, cântecul din plastic, bărbatul începe să integreze pasaje și expresii adulte în cântecul său, făcându-l un indicator mai fiabil al genului.
Aparența culorii este o metodă mai puțin consistentă, cu variații între specii, care se aplică mai bine canarelor care sunt strâns legate sau aparțin aceleiași tulpini. În general, Vallelunga crede că canarul mai palid este de sex feminin.
