După copilărie, de Balboa și-a părăsit orașul natal, căutând avere și succes în altă parte. La fel ca mulți, el a visat să părăsească Spania și să navigheze spre Lumea Nouă, căutând noi oportunități. Balboa a găsit inițial locul de muncă ca fermier pe insula Hispanola, în urma unei scurte expediții spaniole în Columbia.
Cariera sa agricola sa dovedit a fi nereusita, in cele din urma aterizarea Balboa in datorii. El a părăsit urmărirea penală de la colectori de datorii, care s-au strecurat la bordul unui vas de marfă cu destinația San Sebastian, un oraș din Columbia de coastă, în 1510. Balboa a stabilit o așezare în Darien, situat în Panama. În ciuda menținerii păcii, autoritățile din Balboa și spaniol au tratat pe maltratat pe localnici. Balboa și-a asumat poziția de guvernator al lui Darien, exploatând pământul și oamenii pentru aur și bogății. Spaniolul și-a pierdut în cele din urmă poziția de guvernator al lui Pedro Arias Davila, numit de regele Ferdinand al II-lea. În cele din urmă, Davila a executat Balboa, temându-se de o revoltă a lui Balboa și a aliaților.