Caracteristicile fizice ale Asiei de sud-est includ lanțurile muntoase, campiile, peninsulele, coridoarele și insulele. Vietnamul și Indonezia sunt renumite pentru lanțurile lor montane. Cel mai înalt munte din Asia de Sud-Est este Hkakabo Razi din Myanmar, care are o înălțime mai mare de 19.000 de picioare. Alte caracteristici notabile includ bazinul Tonle Sap și Mekong Lowlands din Cambodgia. Insulele și vulcanii din Arhipelagul Malaeziei fac parte și din Asia de Sud-Est.
Peninsula Malay face parte din Asia de Sud-Est și include țările din Thailanda, Singapore și părți din Malaezia și Myanmar. Această peninsulă este împărțită de o zonă montană centrală care include Muntele Tahan. Râurile curg spre estul și vestul Peninsulei. Râul Pahang este remarcabil, deoarece este cel mai lung fluviu din Peninsula Malay, acoperind un total de 271 de mile.
Multe țări din Asia de Sud-Est au granița cu oceanul, astfel încât regiunea are mai multe drepte, golfuri și delte. Acestea includ Straight of Malacca, Singapore Straight și Golful Thailandei. Asia de Sud-Est include, de asemenea, peste 25.000 de insule situate în Arhipelagul Malaeziei. Arhipelagul este alcătuit din mai multe lanțuri mici de insule. Aceste arhipelaguri mai mici includ Indonezia, Insulele Filipine, Insulele Maluku și Noua Guinee și insulele din jur.