Fungii joacă un rol esențial în ecosisteme. Ei sunt responsabili pentru descompunerea materiei organice; eliminarea și reciclarea materiei organice pe teren, furnizând astfel substanțe nutritive și alimente pentru plante, potrivit Fondului pentru Conservarea Pădurilor. În plus, fungi sunt responsabili pentru fixarea azotului în sol.
În cadrul biosferei, ciupercile joacă un rol esențial ca descompunere și reciclare primară a nutrienților. Ciupercile sunt prezente și joacă acest rol în toate habitatele Pământului. Fără fungi, plantele ar pierde sursa principală de nutrienți, materii organice reciclate de ciuperci. Fungii joacă, de asemenea, roluri mutuale cu o varietate de alte tipuri de organisme.
Fixarea de azot este o altă contribuție importantă a ciupercilor în cadrul ecosistemelor, potrivit revistei Science. Stabilirea azotului prin ciuperci a fost dovedit a contribui la biomasa de furnici-cutter, ca parte a unei relatii de simbiotica.
Este cunoscut faptul că ciupercile formează relații reciproce cu cianobacterii și algele verzi, formând astfel licheni. Relații similare reciproce se formează cu o varietate de tipuri diferite de insecte. Contribuțiile pozitive ale acestor bacterii și insecte arată rolurile avantajoase pe care le joacă ciupercile în biosferă.
În timp ce unii ciuperci provoacă boli la om, altele influențează în mod semnificativ și pozitiv capacitatea noastră de a supraviețui prin reciclarea substanțelor nutritive și producerea de alimente vegetale din detrimentul și solul.
