Mecanismul de colorare în ciuperci de albastru de bumbac de la lactofenol este utilizarea lactophenolului ca agent de curățare, ceea ce înseamnă că este capabil să ucidă organismul. Apoi, acidul lactic păstrează structura fungului. Bumbacul albastru este capabil să pată citoplasma cu o anumită nuanță de culoare albastru deschis, astfel încât este posibil ca oamenii de știință să observe diapozitivul care conține celulele fungice.
Colorarea unei mostre a unei celule este procesul de colorare sau de distincție vizuală a anumitor părți ale celulei unul de altul. Acest lucru permite oamenilor de știință să diferențieze părțile celulei și să le respecte mai clar. Colorarea organismelor eucariote poate fi vitală pentru înțelegerea umană a anumitor procese și fenomene biologice. Înțelegerea anumitor tipuri de ciuperci poate fi utilă în dezvoltarea de antibiotice și alte produse și este chiar utilizată pentru fermentarea sau prevenirea bolilor în industriile agricole.
Atunci când se utilizează tehnica de colorare pe bază de albastru de bumbac lactofenol, un om de știință trebuie să ia o diapoziție curată și să adauge o picătură de soluție albastră de bumbac lactophenol pe ea. Apoi, un ac sterilizat poate transfera un strat pe acest fluid înainte de a fi acoperit cu o altă alunecare. Aceasta permite lactophenolului să curățe și să ucidă organismul, iar acidul lactic își menține forma. Celula poate fi vopsită și observată.