Protocolul Secure Channel (SCP) se utilizează în primul rând pentru a transfera fișiere între o gazdă la distanță sau locală sau două gazde locale, în timp ce SFTP permite o gamă mai largă de operațiuni în timpul transferurilor de fișiere într-o rețea. În plus față de transferurile de fișiere, SFTP poate fi folosit pentru activități cum ar fi reluarea transferurilor întrerupte, eliminarea de la distanță a fișierelor și listarea conținutului unui director.
Pe baza protocolului de rețea Secure Shell (SSH), SCP a fost proiectat pentru a furniza canale criptate pentru transferul transferurilor de date securizate între diferite gazde. SCP utilizează Secure Shell (SSH) atât pentru transferuri, cât și pentru autentificare, ceea ce asigură confidențialitatea în timpul tranzitului.
SFTP a fost conceput ca o extensie îmbunătățită a SSH. În plus față de furnizarea de canale de comunicații criptate între computere, acesta oferă chiar mai multe funcții și capabilități de transfer de fișiere decât SCP. SFTP este, de asemenea, mult mai independent de platformă decât Protocolul Secure Channel. O greșeală obișnuită pe care mulți oameni o fac este să vizualizeze SFTP ca o formă mai sigură a protocolului standard FTP. Acest lucru este incorect. SFTP este un protocol diferit, care este independent de FTP și incompatibil cu serverele FTP. O altă diferență cheie între cele două protocoale este aceea că SCP funcționează numai pe servere care execută SSH versiunea 1, în timp ce SFTP funcționează numai cu servere care execută SSH versiunea 2.