Cea mai importantă diferență dintre cele două rase este originea lor, fiecare dintre ele venind din țară în numele lor. În timp ce cele două rase par uneori asemănătoare, există diferențe subtile în aparențele lor. Malinois are un strat fin sau sârmă, în timp ce ciobanii germani au un strat mediu. Ambele rase pot fi negre sau bronz și negru în colorare, dar Malinois poate fi, de asemenea, gri, în timp ce Shepherds german poate fi alb. În plus, Malinois doar se varsă sezonier, în timp ce un ciobanesc german va vărsa continuu pe tot parcursul anului.
Malinoisii belgieni sunt aproape exclusiv crescuți ca câini de câmp, în timp ce rasele Shepherd German pot fi fie câini de câini, fie câini de lucru. Păstorii germani au o speranță minimă de viață puțin mai mică, dar au aceeași durată de viață maximă de 13 ani. Ciobanii germani au de asemenea un minim minim și o greutate maximă mai mare. În cele din urmă, în timp ce câinii au un temperament general foarte asemănător, Malinoisii belgieni nu sunt prea înclinați să fie protectori, în timp ce ciobanii germani nu sunt înclinați să fie receptivi sau independenți.