Aligatorii nu au urechi externe. Cu toate acestea, aligatorii au niște fante mici în spatele ochilor. Fantele ajută aligatorii să audă prin trimiterea de valuri sonore către urechile lor interioare.
Aligatorii deasupra apei au abilități similare de auz la păsări, șopârle și alte animale fără urechi externe. O audiere a unui aligator este egală cu aurul, iar anatomia urechilor aligatorilor le dă o audiere excepțională în timp ce acestea sunt scufundate sub apă. Un aligator începe să audă când vibrațiile călătoresc prin craniu la timpan. Deasupra și dedesubtul apei, aligatorii sunt cei mai sensibili la sunete de aproximativ 800 Hz, ceea ce reprezintă gama de chirpuri făcute prin aligatorii de incubație pentru bebeluși.