Protozoarele trăiesc în mări, râuri, lacuri, iazuri, deșeuri și sol. Apa este o cerință pentru habitatul lor și poate exista în diverse regiuni unde este prezent.
Protozoarele care trăiesc în apă sărată nu necesită vacuole, care sunt structuri în citoplasmă care funcționează în secreția intracelulară. Concentrația de sare din interiorul celulei este similară cu concentrația din apa de mare și nu este nevoie să se contracte și să se scurgă fluidele. Protozoare care posedă aceste structuri și trăiesc în condiții mai puțin sărate, apa goală prin intermediul unui por în membrană și excesul de lichid pătrunde în celulă.
