Șopârlele hibernează în perioadele reci ale anului, făcând casele lor în trunchiuri de copaci, roci și oriunde pot găsi adăpost. Șopârlele sunt ecnotherme cu sânge rece fără capacități interne de încălzire, deci trebuie se bazează pe căldură din surse externe. Când vine iarnă, sunt forțați să hiberneze.
Șopârlele hibernează în general în monoterapie, dar unele specii au fost observate la hibernare de grup. Nevoia de hrană este diminuată sau chiar eliminată în anumite specii în timpul perioadei de hibernare.
Unii șopârle intră în estivare în loc de hibernare. Estivarea are loc în rândul șopârlelor care trăiesc în zonele uscate și fierbinți ale lumii, cum ar fi deșerturile aride, și implică șopârlele care se îngroapă pentru a scăpa de temperaturile extreme.
