Constipația nu este un efect secundar asociat cu formula de soia. Formula de soia este un tratament pentru constipația la sugari. Institutul National de Sanatate clasifica formula de inceput de soia ca o substanta de preocupare minima in ceea ce priveste efectele secundare.
Pe lângă utilizarea sa pentru constipație, formula de soia este prescrisă la sugari cu alergii la lapte. Trei procente din sugari din Statele Unite au alergii la lapte și, în cele din urmă, le depășesc în cele din urmă. Laptele de soia este cel mai frecvent tratat pentru această alergie și este echivalent din punct de vedere nutrițional cu formula de lapte de vacă. Formula de soia cuprinde 12 la sută din vânzările formulate în Statele Unite începând din 2014, ceea ce reprezintă o scădere cu 50 la sută a vânzărilor de la vârf în 1999.
Singurul efect secundar documentat al formulării de soia la om este efectul pe care îl are asupra celor cu alergie la soia. Studiile pe animale arată o corelație între aportul ridicat de soia și pubertatea timpurie datorită nivelurilor crescute de estrogen, însă această constatare nu este confirmată la om. Institutul National de Sanatate si Departamentul Agriculturii din Statele Unite citeaza studii pe termen lung ca dovezi ca formula de soia este o alternativa sigura la formula de lapte de vaca, desi ambele agentii ii incurajeaza pe parinti sa hraneasca laptele matern in loc de formula ori de cate ori este posibil.