Bureții folosesc în principal substanțe chimice pentru a se proteja și substanțele chimice sunt fie toxice, fie doar gustoase. Aceasta nu numai că împiedică dărâmarea, ci și concurența, deoarece substanțele chimice pe care le eliberează împiedică creșterea altor organisme . Speciile individuale au alte strategii, cum ar fi burrowing în corali, roci sau moluște pentru a obține protecție.
O altă strategie pe care mulți corali o folosesc pentru a păstra prădătorii, cum ar fi stelele de mare afară, varsă mici bucăți ale elementelor lor scheletice, numite spicule, pe podeaua mării. Acestea se pot acumula într-un strat gros, descurajând prădătorii care trebuie să se crawleze pentru a ajunge la ei. Nu toate bureții au un mecanism de apărare directă. Bureți de sticlă nu produc nici o toxină, dar trăiesc în oceanul foarte adânc, unde prădătorii sunt rare.
În ciuda apărării lor, bureții pot face doar mișcări ușoare, când se pot mișca deloc. Ele sunt vulnerabile la orice organisme care își pot depăși apărările și sunt pradă multor specii de țestoase, pești și nevertebrate. Bureții pot beneficia parțial de pradă, totuși, deoarece fragmente de burete lăsate în urmă de către prădători pot supraviețui adesea și se restabilească ca niște organisme independente. Organizația lor extrem de simplă de nivel celular înseamnă că acestea pot supraviețui adesea chiar și daunelor grave cauzate de pradă sau efecte asupra mediului.