Modul principal în care animalele sau, mai precis, celulele animale stochează glucoza este într-un compus cunoscut sub numele de glicogen. Glicogenul este depozitat în primul rând de celulele hepatice, dar unele sunt stocate, de asemenea, utilizați dacă este necesar. Moleculele de glicogen sunt alcătuite din multe mii de molecule de glucoză legate între ele de grupările alfa acetal într-o formă foarte ramificată, foarte compactă.
Glucoza este combustibilul primar folosit de organism pentru a crea adenozin trifosfat sau ATP, moneda energetică utilizată de fiecare celulă de pe planetă. Creierul, în special, se bazează aproape în întregime pe un flux continuu de glucoză pentru funcționare. Muschii trebuie, de asemenea, să fie gata să folosească energie într-o rată mult mai mare decât digestia și circulația. Glicogenul este modalitatea organismului de a menține o formă rapidă de energie accesibilă pentru aceste sisteme vitale.
Capacitatea organismului de a stoca glicogen este limitată. Celulele hepatice și musculare pot stoca atât de mult. Când există exces, glucoza nu este stocată în glicogen, ci este în schimb transformată în grăsime, o altă formă de stocare compactă a energiei, dar una care durează mai mult decât glicogenul. Celulele musculare utilizează calorii din digerarea alimentelor sau grăsimilor atunci când cererea de energie este scăzută, folosind glicogenul pentru eforturi mai intense.