Peștele are un sistem digestiv care începe la gură și se termină la nivelul anusului. Este de obicei compusă din gură, esofag, stomac, pancreas și intestin. Nu toate speciile de pește au, cu toate acestea, un stomac, cum ar fi Cyprinidonts și Cyprinids, iar peștii erbivori au digele digestiv mai lungi decât peștii carnivori.
Alimentele se iau în organism prin gură și apoi spre faringe unde este măcinat cu dinți faringieni înainte de a intra în esofag. Stratat cu mușchi, pereții esofagului se pot extinde pentru a putea găzdui obiecte mari. Alimentele sunt apoi sparte în stomac prin substanțe eliberate din glandele gastrice. Unele specii de pește au un gizzard la începutul stomacului, care începe procesul digestiv. Ciclul pielic se află la capătul stomacului la multe specii de pești și acestea continuă procesul digestiv și extinde intestinul. Digestia este ajutată de secreția de enzime din pancreas în intestin unde se produce cea mai mare parte a absorbției alimentare. Fecalele apoi părăsesc corpul prin anus.