Specificitatea enzimelor se referă la tendința enzimelor de a cataliza un set specific de reacții chimice. După cum explică Worthington Biochemical Corporation, unele enzime sunt absolut specifice și doar catalizează o reacție chimică. Alte enzime prezintă specificitatea grupului și acționează numai asupra moleculelor cu grupări funcționale date, cum ar fi grupările amino. Legături specifice enzimelor acționează asupra legăturilor particulare, în timp ce enzimele specifice stereochimice funcționează pe izomerii sterici sau optici.
Conform unui studiu publicat în anul 2010 în Enciclopedia de Științe ale Vieții, specificitatea apare în virtutea structurii tridimensionale a situsului la care enzima se leagă cu substratul țintă. În acest fel, enzimele se leagă doar cu un anumit interval de reacții chimice. Unele enzime includ o structură secundară care se potrivește substratului chimic și funcționează ca un corector, care asigură în plus specificitatea enzimelor. Unele enzime care catalizează o varietate de substraturi chimice se comportă diferit în funcție de substratul cu care se leagă. De exemplu, atunci când o enzimă se leagă cu un substrat preferat, enzima se poate conforma substratului mai complet decât ar fi dacă s-ar lega cu un substrat ne-preferat.
Studiul Encyclopedia of Life Sciences din 2010 explică faptul că specificitatea nu este întotdeauna absolută. Din când în când, noile enzime evoluează din interacțiunile cu reacții chimice alternative.