Microscoapele de disecție, cunoscute și sub numele de microscoape stereo, sunt instrumente științifice utilizate pentru obținerea imaginilor tridimensionale ale probelor obținute. Microscopul tratează două lentile diferite pe specimen pentru a obține imaginea.
Microscoapele cu disecție prezintă avantaje și dezavantaje. Ele sunt singurele microscoape care pot produce imagini tridimensionale și au o profunzime superioară a câmpului în comparație cu microscoapele compuse tipice. Imaginile lor tridimensionale pot fi utile în determinarea locației și funcției exacte a obiectelor. Cu toate acestea, ele au o mărire mică. Acest lucru împiedică utilizatorul să vadă imagini foarte detaliate, dar permite ca porțiuni mai mari ale obiectului să fie vizualizate în același timp.