Dominanța incompletă, cunoscută și sub numele de dominare parțială, se întâmplă atunci când două alele produc proteine, dar una nu funcționează așa cum trebuie. În timp ce în unele cazuri această situație nu afectează o persoană, de alte ori este principala cauză a defectelor congenitale sau a deceselor infantile.
Acest tip de expresie genică poate fi mai greu de văzut la om decât în alte organisme. Un exemplu obișnuit care este folosit pentru a arăta dominanța incompletă este culoarea frunzelor de snapdragon. Atunci când genele unei roșii și a unei flori albe sunt puse împreună, există o gena pentru flori roșii și una pentru alb. Expresia dominației incomplete este văzută atunci când florile care înfloresc se dovedesc a fi roz.