Zigoții normali umani au 46 de cromozomi organizați în 23 de perechi, același număr pe care majoritatea adulților le au. Împreună, aceste 46 de cromozomi conțin aproximativ 25 000 de gene, conform Genomului Național al Omului Institut de cercetare. Uneori, embrionii umani se dezvoltă cu un cromozom suplimentar care influențează dezvoltarea sindromului Down.
NHGRI indică o distincție între primele 22 de perechi de cromozomi sau autozomi și ultima pereche numită "cromozomi sexuali". Fiecare om are un set complet de autozomi de la concepție și, prin urmare, le poartă pe parcursul fazei zigotului de gesticulare. Unii oameni sunt concepuți cu un număr mai mic de cromozomi de sex. Această afecțiune, cunoscută sub numele de sindromul Turner, duce întotdeauna la o zigotă feminină, deoarece cromozomul lipsă este întotdeauna bărbatul sau "Y", cromozomul.
Anomaliile numerice, cum ar fi acestea, nu sunt prezente în majoritatea zigoturilor în curs de dezvoltare, totuși, majoritatea oamenilor poartă o completare normală de 46. Interesant, acest număr este mai mic decât cel al majorității maimuțelor. Biroul de Științe al Departamentului de Energie descrie modul în care numărul doi al cromozomului uman pare a fi aranjat ca și cum ar fi rezultat din fuziunea unei perechi de cromozomi ancestrali, pe care o identifică drept cea mai explicită explicație pentru diferența de număr de cromozomi între oameni și maimuțe.