Beneficiul cel mai convingător al unui sistem de întreprindere este acela că permite colaborarea și eficiența între departamentele dintr-o organizație. Investițiile semnificative adesea necesare în infrastructura și procesele organizaționale, împreună cu sarcina planificării strategice și a muncii în echipă inter-organizatorică, sunt provocări.
Când a reușit, implementarea unui sistem de întreprindere oferă potențialul unor avantaje competitive majore. Organizațiile pot depăși concurenții cu o utilizare mai eficientă a resurselor, o mai bună gestionare generală a relațiilor cu clienții și o eficiență operațională îmbunătățită. Unele companii au un sistem care corelează previziunile de vânzări cu bugetele de producție și inventarul de materiale, de exemplu.
Sistemele de întreprindere sunt conduse de platforme software. Construirea unei infrastructuri optime, inclusiv soluția software potrivită, reprezintă o investiție majoră pentru multe companii. Punerea la punct a sistemului corect de la început este o preocupare. Unele companii nu au timp să-și planifice strategia încă de la început, ceea ce sporește riscurile unei investiții proaste. Alții nu primesc nici o implicare în planificarea strategică din partea unor lideri de departamente suficienți, fie construiesc o strategie eșuată. Chiar și cu o strategie atentă, implementarea unui sistem care să alinieze tehnologia cu implicarea tuturor lucrătorilor în cadrul organizației este un obstacol. O cultură a colaborării sporește șansele de succes, însă sunt necesare și comunicări clare și fluxuri de lucru.