Subdiviziunile majore ale creierului sunt prosencephalon, mesencephalon și rhomencephalon. Acestea sunt, de asemenea, numite creierul antebraț, midbrain și spatele creierului. Aceste trei diviziuni sunt încă împărțite în ventricule, subdiviziuni ale ventriculelor și structuri principale ulterioare.
Prosencephalonul constă din ventriculul lateral și cel de-al treilea ventricul. Aceste două ventricule sunt subdivizate în telencephalon și diencephalon. Din aceste două subdiviziuni sunt definite următoarele structuri principale: cortexul cerebral, ganglionii bazali, sistemul limbic, talamusul și hipotalamusul.
Mesencephalon este alcătuit din apeductul cerebral care este alcătuit dintr-o subdiviziune cunoscută sub numele de mesencephalon. Această subdiviziune conține două structuri principale numite tectum și tegmentum.A treia subdiviziune majoră a creierului, Rhombencephalon, conține un ventricul pur și simplu numit al patrulea ventricul. Acest ventricul este alcătuit din metencefal și mielencephalon. Aceste două subdiviziuni conțin trei structuri principale: cerebelul, pons și medulla oblongata.
Aceste trei subdiviziuni principale formează creierul în diferite perioade prin dezvoltarea embrionului. Porțiuni ale creierului care controlează aspecte mai primitive ale tuturor mamiferelor din regnul animal se formează mai întâi. În urma acestei dezvoltări, mai multe aspecte rafinate ale creierului uman încep să se formuleze. Este cu ajutorul acestor trăsături anatomice foarte rafinate că creierul uman este diferențiat de alte specii.
