Poluarea apei nutritive provoacă o creștere exagerată a algelor și a plantelor microscopice, în timp ce poluanții toxici din apă pot pune plantele în stres sau chiar le pot ucide. Dacă poluarea are un efect pozitiv sau negativ asupra vieții plantelor, aceasta afectează echilibrul ecosistemului, adesea cu efecte devastatoare.
Poluarea cu nutrienți apare adesea din cauza multor activități umane, inclusiv a scurgerilor din terenurile agricole. Ploaia dizolvă fosforul și azotul din îngrășămintele aplicate culturilor și deșeurilor animale. Creșterea nutrienților conduce la o potențială floare de alge care provoacă pete moarte în apă din cauza epuizării oxigenului.Ploaia acide este o altă formă de poluare a apei care afectează viața plantelor. Ploaia acide apare atunci când apa din atmosferă dizolvă substanțele chimice, inclusiv dioxidul de sulf și dioxidul de azot, formate de vulcani și motoarele de automobile. Pe măsură ce precipitațiile cad la pământ, acestea poluează alimentarea cu apă. Acesta scade pH-ul apei și, în cele din urmă, solul, inhibând creșterea unor plante și uciderea altora.
Fitotoxicitatea apare când toxinele se acumulează în mediu și sistemul radicular al plantei le absoarbe. Produsele chimice se acumulează în sistemele de apă și în mediu cu efect cumulat. Mercurul, care afectează și peștii și animalele, are un efect toxic asupra plantelor. Semințele nu reușesc să crească, în timp ce plantele mature încep să se usuce și să moară din cauza fitotoxicității.
