Diferențele fizice dintre aligatori și crocodili includ culoarea pielii, formele fălcilor și plasarea dinților. Alte diferențe includ mediul lor și agresivitatea.
Aligatorii au de obicei pieliță mai închisă decât crocodili. Aligatorii au fălci largi, rotunde, cu mufe în formă de U. Crocodilii au fălcile înguste, ascuțite, cu boturi în formă de V. Toate fălcile aligatorilor sunt mai puternice decât fălcile de crocodil și le permit să mănânce prada cu cochilii, în timp ce fălcile crocodil sunt proiectate pentru o gamă mai largă de pradă. Dinții inferior ai aligatorului nu pot fi văzuți atunci când gura sa este închisă deoarece maxilarul superior este mai lat decât maxila inferioară. Fălcile superioare și inferioare ale crocodilului sunt egale în mărime, iar al patrulea dinte proeminent pe maxilarul inferior se potrivește în afara maxilarului superior atunci când gura este închisă. Aligatorii trăiesc în habitate de apă dulce, în timp ce crocodilii trăiesc în habitate cu apă sărată, deoarece o glandă în limbile lor scapă de sare. Aligatorii sălbatici trăiesc numai în Statele Unite și China. Crăciunii sălbatici trăiesc în întreaga lume. Crocodilii tind să fie mai agresivi. Există diferite specii de aligatori și crocodili. Fiecare specie este unică, deci există câteva excepții de la aceste diferențe comune. Un exemplu este crocodilul indian, care are o falca larga asemanatoare unui aligator, dar are si al patrulea dinte proeminent al unui crocodil.
