Unele dintre dezavantajele integrării economice regionale includ o schimbare a forței de muncă, o mai mică eficiență în comerț, crearea de bariere comerciale în calea ne-membrelor și pierderea suveranității într-o oarecare măsură. cu toate acestea, considerată o cheie a dezvoltării internaționale, deoarece descompune mai multe bariere comerciale dintre statele membre.
Unul dintre dezavantajele integrării economice regionale este că încurajează o schimbare a forței de muncă. Dacă, de exemplu, o anumită regiune oferă oportunități lucrative, majoritatea profesioniștilor sunt obligați să se mute din țările lor natale în țară cu oportunități mai bune. Acest lucru poate crea noi provocări pentru țara de origine pe măsură ce încearcă să concureze cu ceilalți.
Un alt demers este că ineficiența schimburilor comerciale poate apărea. De exemplu, dacă o țară care se ocupă în mod tradițional de comerțul cu o anumită țară, comerțul poate fi forțat să se oprească dacă se creează noi legi care împiedică țările să tranzacționeze cu alții care nu aparțin uniunii economice. Țările din cadrul uniunii pot oferi prețuri mai mici sau pot fi prea scumpe, făcând comerțul dificil sau mai puțin profitabil.
Odată cu intrarea în vigoare a noilor legi regionale, țările membre își pot pierde suveranitatea în anumite chestiuni. Noile legi pot ajuta toate țările să se consulte și să construiască un consens înainte de a face lucruri noi, iar acest lucru poate fi privit ca o pierdere a suveranității.