Dezavantajele clonării includ riscul crescut de boli moștenite, lipsa variației genelor, etica și dogmele religioase asociate cu aceasta. Termenul de clonare se referă la un număr de procese utilizate pentru producerea de copii identice genetic ale unei entități biologice.
Riscul crescut de boli moștenite se datorează faptului că toate clonele au aceleași gene și astfel pot fi susceptibile la un anumit tip de boală. Acest lucru poate duce la o boală care șterge o întreagă populație. Un alt dezavantaj este lipsa variației genei. Reproducerea naturală asigură o combinație a diferitelor gene care au ca rezultat indivizi unici.
Dezbaterea clonării a atras opinii în toate sferele. Printre cercul religios, de exemplu, rămâne un subiect controversat. Majoritatea guvernelor au fost necondiționate în îmbrățișarea pe deplin a clonării, din cauza fricii de reacție din partea electoratului.