Funcția principală a glandei pineale este de a secreta melatonina, care joacă un rol în reglarea ciclului somnului și în dezvoltarea sexuală. Glanda pineală ajută de asemenea la reglarea funcțiilor endocrine și la transformarea semnalelor nervoase în semnale endocrine. De mulți ani, oamenii de știință și medici au fost confundați cu ceea ce face de fapt glanda pineală, mult timp după ce au descoperit funcțiile celorlalte organe endocrine. Oamenii de stiinta nu sunt pe deplin siguri de rolul pe care joaca glanda pineala in organism, desi acum cred ca are legatura cu secretia melatoninei, singurul hormon cunoscut pe care il produce.
Secreția melatoninei este reglată de lumină, deoarece glanda pineală produce niveluri ridicate atunci când este întunecată și se oprește să o producă atunci când este ușoară.
Glanda pineală este cunoscută de mult ca "al treilea ochi", datorită localizării sale în apropierea centrului creierului. Este un organ mic, roșiatic-gri, care este în formă de con de pin și aceasta este forma care dă numele glandei pineale. Pe măsură ce oamenii îmbătrânesc, glanda pineală devine adesea calcificată datorită depozitelor de fosfor, calciu și fluor, care se acumulează în timp.