Cele trei părți ale unei sinapsă sunt sfârșitul presinaptic, cleftul sinaptic și încheierea postsynaptică. Un impuls care călătorește de la o celulă nervoasă la alta trebuie să treacă prin toate cele trei părți pentru a traversa cu succes sinapsă și pentru a călători în următorul neuron.
Impulsurile nervoase se deplasează de la corpul celulei nervoase până la capăt, prin terminalul axon, care este o lungă distanță. La capătul îndepărtat al acestui terminal se află sfârșitul presinaptic. Această structură conține buzunare de neurotransmițători chimici care sunt eliberați ca răspuns la apariția impulsului din nerv.
După eliberare, neurotransmițătorii traversează cleftul sinaptic, care este doar un decalaj scurt între celulele nervoase. Neurotransmițătorii neutilizabili sunt reluați de sfârșitul presinaptic după terminarea transmisiei. Proteinele neurotransmițătoare care ajung la ținta lor sunt preluate de a treia parte a sinapselor, terminarea postsynaptică.
Terminarea postsynaptică are structuri de receptor specializate pe suprafața sa. Acești receptori acceptă neurotransmițătorii în modul în care o încuietoare acceptă o cheie. Sosirea unei proteine de transmisie declanșează un impuls în finalul postsynaptic care călătorește un terminal scurt către corpul principal al celulei.