Tratamentul pentru E. coli la câini implică, în general, injecții pentru refacerea fluidelor corporale, administrarea unei soluții de glucoză pentru tratarea diareei și a antibioticelor, în conformitate cu PetMD. Majoritatea câinilor care contractează E. coli a fi spitalizat și a primit un tratament de urgență; deoarece un cățeluș nou-născut are un sistem imunitar nedezvoltat, tratamentul este, în general, nereusit la câinii de această vârstă.
După tratamentul pentru E. coli la câinii adulți, este necesară o activitate restrânsă, monitorizare, căldură și odihnă în cuști în timpul perioadei de recuperare, după cum afirmă PetMD. Este posibil să fie necesară hrănirea cu flacoane sau chiar fluidele intravenoase pentru a se asigura că câinele afectat primește nevoi nutriționale adecvate. În timp ce câinele se recuperează, un veterinar poate preleva sângele câinelui pentru a determina starea de infecție a câinelui. Odată ajuns acasă, câinele va trebui să fie urmărit pentru orice simptome de eșec și temperatura corpului va trebui să fie monitorizată. Tratamentul ulterior depinde în mare măsură de progresul câinelui.Pentru pui, cel mai important mod de a preveni E. coli este de a se asigura că asistă și primește colostrul produs de câine-mamă în primul său lapte după naștere. Schimbarea așternutului pentru așternut este la fel de importantă, la fel ca și spălarea mâinilor înainte de manipularea căței nou-născuți care își dezvoltă încă sistemul imunitar.