Ciupercile sunt structurate pe filamente numite hifee, care sunt alcătuite din șiruri de celule și separate unele de altele de septe sau de cruce. Multe dintre aceste hife grupate împreună formează miceliu.
Septa sau pereții transversali între fiecare filament sunt plina de pori, permițând curgerea și transportul nutrienților în ciuperci. Deși majoritatea ciupercilor sunt alcătuite din filamente de hifa care formează o structură de miceliu, hifele coenocitare sunt net separate prin pereți.
O celulă fungică este alcătuită dintr-un nucleu și organele. Ca și plantele, celulele fungi sunt înconjurate de pereți celulari, dar pereții celulari nu au cloroplaste, care sunt unitățile în care se produce fotosinteza, deoarece ciupercile nu fac alimente de la soare. Pereții celulari sunt alcătuiți din patru componente: chitină, glucani, proteine și melanină. Chitina este alcătuită din fire de zahăr lipite împreună pentru a forma un model puternic în perete. Glucani sunt, de asemenea, alcătuite din zahăr lipit, dar au o formă mai flexibilă. Melanina ajută la întărirea peretelui celular, precum și la protejarea ciupercilor împotriva daunelor provocate de soare. Unele dintre proteine mențin apă în interiorul celulelor, protejând ciuperca de deshidratare.
