Singura secreție a esofagului este mucusul, pentru lubrifiere. Esofagul nu secretă nicio substanță chimică digestivă, deoarece rolul său este de a livra boluri de alimente de la faringe până la stomac.
Mucusul este produs de glandele mucoase situate în mucoasă, mucoasa esofagului. Această căptușeală este compusă din epiteliu scuamos stratificat, care este rezistent la traume din alimente abrazive. În timpul înghițiturii, bolurile de mâncare împrășesc esofagul, determinând mucusul să fie exprimat din glandele mucoase. Contracțiile peristaltice duc apoi la alimente în stomac. La om, durează patru până la cinci secunde pentru ca un bolus de alimente să treacă prin esofag.
