Virușii sunt numiți științific în mod similar cu organismele; acestea se referă la numele genului și al speciei. Deasupra acestora, două sisteme de clasificare, complementare fiecăruia, creează o taxonomie pentru viruși.
Comitetul Internațional pentru Taxonomia Virușilor organizează viruși la una din cele șapte ordine care conțin familii și sub-familii înainte de desemnarea genului și a speciilor. Virusurile sunt provocatoare pentru a clasifica mai sus taxonomia unui ordin, deoarece acestea au genomi relativ mici și o rată ridicată de mutație. Sistemul de clasificare Baltimore, definit pentru prima dată în 1971, separă virușii în șapte grupuri bazate pe combinația lor de acid nucleic în ADN sau ARN, indiferent dacă sunt simple sau dublu catenare, metodă de replicare și polaritate a acidului nucleic în pozitiv sau negativ .
