Aligatorii sunt animale cu sânge rece și preferă caldura și temperaturile apei calde. În zonele în care iernile sunt reci, aligatorii vor încerca să rămână scufundați în apă sau să găsească o grămadă de odihnă. Aceste zone oferă mai puține schimbări de temperatură decât să se afle în aer liber și pot ajuta aligatorul să păstreze căldura.
Când aligatorii se învârt, ei rămân foarte liniștiți. Mulți se vor afla aproape de partea de jos a burrow lor, doar de suprafață pentru a respira. Unii plutesc pe apă sau se află pe vegetație în timpul celor mai reci din iarna.
