Metanogenii trăiesc în medii anaerobe, cum ar fi mlaștini, mlaștini, rume de bovine, intestine de termite și nămoluri de epurare. Aceste bacterii sunt chemoautotrofe, care folosesc hidrogenul ca sursă de electroni pentru a reduce dioxidul de carbon. Ei emit metanul ca produs deșeu al acestui proces.
Metanogenii sunt microorganisme anaerobe unicelulare. Ei sunt litotripi și își produc propria energie prin procesul de metanogeneză. În habitatele lor, metanogenii degradează molecule și compuși organici complexi pentru a ajuta la reciclarea elementelor și substanțelor nutritive în ecosistem. În total, produc aproximativ 109 tone de metan pe an, aproximativ jumătate din care scapă în atmosferă.
