Sursa râului Missouri este situată la primăvara lui Brower, la izvorul afluentului cunoscut sub numele de râul Jefferson. Primăvara lui Brower a fost descoperită în Munții Centenarului de către Jacob V. Brower în anii 1890.
Sursa unui râu este definită ca fiind punctul de pe râu care este cel mai îndepărtat de la sfârșitul acestuia. Cu toate acestea, atunci când Lewis și Clark au ajuns în zona care este acum Missouri Headwaters State Park, Lewis a decis că nici una din cele trei furci nu era superioară celorlalte și a spus că locația de la trei furci a fost sursa Missouri. Prin urmare, determinarea sursei Missouri a impus Lewis și Clark Trail Heritage Foundation pentru a determina care dintre cei trei afluenți este cel mai lung.