Înmormântarea lui Annette Funicello a fost efectuată la Chapel Memorial Chaplin din Bakersfield, California. A fost o ceremonie privată. Unele conturi susțin că Funicello a fost îngropat de fapt la Parcul Memorial Forest Lawn din Hollywood Hills, California, dar aceste rapoarte au fost contestate.
Ms. Funicello a fost de 70 de ani când a decedat de complicațiile legate de scleroza multiplă, o boală în care sistemul imunitar se mănâncă la acoperirea protectoare a nervilor. Funicello a anunțat în mod public starea de sănătate a acesteia în 1992. Semnele care ar fi indicat faptul că Funicello începea să sufere de MS au fost observate încă din 1987, când Funicello a experimentat vrăji amețitoare în timp ce lucra cu actorul Frankie Avalon. Nu a abordat problema la momentul respectiv.
