În Statele Unite, aligatoarele se găsesc în sud-est, inclusiv în Carolina de Sud. Ele pot fi găsite și în Florida, Alabama, Georgia, Mississippi și Louisiana.
Aligatorii nu au toleranță la sare și, prin urmare, se găsesc în medii de apă dulce. Aligatorii preferă un climat mai cald și zone care au o cantitate mare de pradă, vegetație și noroi. Cu toate acestea, pot tolera temperaturi de îngheț în apă. Aligatorii locuiesc de obicei în mlaștini și mlaștini, dar pot fi găsiți și lângă râuri sau mici corpuri de apă.
Aligatorii creează burrowuri de până la 20 de metri adâncime în bănci de noroi. Ei folosesc spărturile sau densele pentru a hiberna în timpul vremii reci.
