Bacteriile ajută la menținerea sănătății ecosistemelor prin distrugerea materiei moarte și a ciclului de nutrienți în forme utilizabile. Bacteriile trăiesc în toate mediile și oferă cea mai mare parte a oxigenului de pe Pământ.
Bacteriile sunt descompunere care descompun materialele organice din sol. De exemplu, bacteriile ajută la descompunerea materiei moarte, cum ar fi arborii căzuți, în nutrienți utilizabili pentru organismele vii din cadrul ecosistemului. Rezultatul descompunerii materiei moarte duce la un pământ mai bogat care poate susține diverse ecosisteme.
Bacteriile cicluri nutritive, inclusiv azot și carbon, pentru a transforma substanțele nutritive în forme utilizabile. De exemplu, bacteriile transformă carbonul în dioxid de carbon, care este necesar pentru fotosinteză, proces care permite plantelor să producă energie din lumină. Fără bacterii, producătorii primari ar înceta să supraviețuiască. Producția de oxigen este un rezultat direct al activității bacteriene. De exemplu, cianobacteria, o bacterie prezentă în oceane, produce o cantitate semnificativă de oxigen disponibil pe Pământ.
Bacteriile transformă azotul în nitrați sau nitriți, care sunt forme de azot pe care plantele le pot folosi pentru a crește. Unele plante, cum ar fi fasolea, stochează bacterii producătoare de azot în sistemele lor radiculare pentru a asigura o creștere corespunzătoare. Bacteriile, de asemenea, trăiesc în interiorul animalelor și sunt folosite de acele animale pentru a distruge alimentele în nutrienți utilizabili. De exemplu, vacile și girafele utilizează bacterii în stomac pentru a descompune materia vegetală, astfel încât produsele alimentare să fie digerate mai ușor, permițând animalelor să mănânce alimente de slabă calitate pentru a supraviețui.
