Potrivit legendei japoneze, Japonia a fost descoperită de Nigini no Mikoto, care a fost trimisă în regiune de către zeița soarelui Amaterasu pentru a stabili domnia. Nepotul său, Jimmu, a devenit împărat în 660 î.H. Jimmu este considerat primul Împărat al Japoniei.
Amaterasu-omikami este o zeita Shinto care este considerata stramosul familiei imperiale japoneze. Nepotul ei, Nigini no Mikoto, a primit un set de bijuterii, o sabie și o oglindă pe care să o ia cu el atunci când a înființat monarhia japoneză. Începând cu anul 2014, oglinda se află încă în sanctuarul interior al Ilea Shrine din prefectura Mie.
O mare parte din cea mai veche istorie a Japoniei este cunoscută doar ca legendă. Istoria înregistrată a țării a devenit mai stabilă în timpul domniei împăratului Keitai din anii 507-531.