Geografia imperiului inca a fost în mare parte montană și a ocupat o mare parte din coasta de vest a Americii de Sud. O mare parte a imperiului Inca a existat într-o zonă climatică cunoscută sub numele de tierra fria. p>La vârf, imperiul Inca ocupa aproape 2.500 de mile de-a lungul coastei de vest a Americii de Sud, de la Quito, sudul Ecuadorului până la Santiago, Chile. Caracteristica geografică principală a acestei regiuni este Munții Andes, o zonă bogată în diversitate geografică. Regiunea Andină din America de Sud are o gamă geografică de la deșert la pădure tropicală până la ghețar. De la munți înșiși, spre vest până la coastă, este o regiune a deșertului. Oasele fac viața posibilă în această regiune aridă, dar Imperiul Inca a inclus unul dintre cele mai brutale deșerturi ale pământului - părțile din Atacama - care nu au înregistrat precipitații în istoria umană înregistrată.
Țările Lowelor susțin pădurile tropicale și savanele, în timp ce altitudinile mai mari devin păduri de nor. Pădurea din pădure este rece și umedă, cu un acoperământ acoperit cu nor care predomină aproape 300 de zile ale anului. Clima aici susține vegetația și fauna sălbatică găsite nicăieri altundeva pe Pământ.
O trăsătură importantă a imperiului Inca este Lacul Titicaca, între națiunile din Peru și Bolivia. Lacul Titicaca se află într-o zonă climatică cunoscută sub numele de tierra fria. Geografia unică și clima lacului oferă unele dintre cele mai bune terenuri agricole din regiune.