Modul Pixelmon "Minecraft" combină clădirea și elementele creative ale "Minecraft" cu aventura și colectarea elementelor "Pokémon". Un utilizator poate prinde Pokémon, antrenori de luptă sau poate explora lumea Pixelmon utilizând modul
Primul pas în utilizarea pachetului de moduri Pixelmon este instalarea acestuia prin intermediul tehnologiei Launcher Technic sau Forge. Cu fiecare joc nou apare o casetă de dialog și îi solicită jucătorului să-și aleagă startul Pokémon. Bilele Poké și alte echipamente sunt realizate folosind materiale comune "Minecraft", cum ar fi lingouri de fier și butoane de piatră.
Când battling sau prinderea unui Pokemon sălbatic, lovind-o cu o minge Poké aruncat deschide un meniu de luptă creat în stilul jocurilor originale "Pokémon". Jucătorii de la Pixelmon pot căuta lumea să colecteze unul din fiecare Pokémon, să lupte și să învingă ceilalți formatori sau să își construiască propriile structuri personalizate. Alte hărți și lumi Pixelmon sunt, de asemenea, disponibile pentru explorare.
Dacă căutați opțiuni suplimentare de joc și extensii, jucătorii se pot alătura unui server "Minecraft" dedicat Pixelmon. Aceste servere permit mai multor jucători să se unească și să construiască, să lupte sau să facă schimburi comerciale. Unele servere personalizează experiența Pixelmon cu moduri suplimentare care elimină daunele cauzate de cădere și foamea, în timp ce altele adaugă obiective și concursuri de grup. De asemenea, serverele oferă chat deschis cu alți jucători și opțiuni comerciale pentru schimbul de Pokémon.