Temperatura, nivelul pH-ului și concentrațiile enzimei și substratului afectează funcționalitatea enzimelor. Inhibitorii chimici pot afecta de asemenea modul în care enzimele funcționează și reduc eficacitatea acestora.
Temperatura afectează energia cinetică a oricărei molecule date. Temperaturile mai calde oferă o mai mare energie cinetică, sporind șansele de coliziuni moleculare reușite. Deasupra unei temperaturi optime, structura enzimatică începe să se descompună, deoarece legăturile moleculare sunt rupte și potențialul de activitate catalitică este redus.
Ca temperatura, există și un nivel optim de pH pentru funcționalitatea enzimelor. Modificările nivelurilor de pH pot face sau pot rupe legăturile moleculare, modificând forma enzimelor și impactând direct eficacitatea enzimei.
Rata reacțiilor catalizate de enzime depinde de concentrațiile enzimei și substratului. Rata reacției crește deoarece concentrația fie este crescută. Rata de creștere crește până când situsul activ este saturat cu substrat. Dacă concentrația substratului este ridicată și temperatura și pH-ul sunt menținute la un nivel constant, viteza de reacție este direct proporțională cu concentrația enzimei.Chimicalele numite inhibitori pot reduce sau chiar opri activitatea enzimatică catalitică. Inhibitorii activi orientați la situs ocupă situsul activ și concurează cu substratul pentru situsul activ. Alți inhibitori, numiți inhibitori direcți ai site-ului, se atașează la structura enzimatică și distorsionează forma sa.
