Potrivit zborului de zbor al NASA, o bună rutină de antrenament Nautilus este aceea care mărește volumul de muncă progresiv cu fiecare sesiune de antrenament și suplimentează antrenamentele de mare intensitate cu perioade de repaus. Antrenamentele ar trebui să înceapă cu cea mai mare mișcările musculare și se procedează la cele mai mici, începând cu soldurile, picioarele și torsul, urmate de lucrul în brațe, talie, spate și gât.
Facilitatea de zbor de la NASA recomandă efectuarea unui set de patru până la șase exerciții pentru corpul inferior, urmată de un set de șase până la opt exerciții pentru corpul superior. Fiecare exercițiu trebuie efectuat la un nivel de rezistență care permite opt până la 12 repetări ale fiecărui exercițiu. Repetițiile trebuie efectuate încet, fără probleme, cu formă bună și cu forță constantă. Odată ce s-au atins 12 repetiții cu privire la un exercițiu dat, trebuie adăugată o rezistență suplimentară de 5 procente pentru următorul antrenament. Formarea ar trebui să se limiteze la trei ori pe săptămână, înregistrându-se lista cu data, numărul de repetări și nivelul de rezistență al fiecărui antrenament.
DailyBurn Tracker sugerează utilizarea mai multor mașini Nautilus într-o rutină bună de antrenament Nautilus, inclusiv presa pentru picioare, extensiile piciorului și buclele pentru picioare pentru corpul inferior. Site-ul recomandă, de asemenea, presa pieptului, presa pentru umăr, laturile (latissimus dorsi), prelungirile predicatorului și triceps pentru corpul superior și rândurile de cabluri așezate și abdomenul pentru mușchii de bază.