Fiecare protează taie legăturile într-un anumit punct din lanțul de peptide și fiecare funcționează cel mai bine la un anumit pH. De exemplu, chymotripsina are cea mai bună activitate la pH8, care este ușor alcalin. Pepsin funcționează cel mai bine la pH2, care este extrem de acid. Acest lucru se datorează faptului că pepsina este eliberată de celulele din stomac, unde produsele alimentare sunt procesate într-o baie de enzime și acid clorhidric. Totuși, tripsina și chymotripsina sunt produse în pancreas și secretate în intestinul subțire.
Bromelaina se găsește în fruct și tulpina ananasului. Bromelian și papain sunt utilizați ca adjuvanți de carne și ca suplimente pentru tratarea afecțiunilor medicale, cum ar fi leziunile sportive și rănile.