Datorită varietății de terenuri și ecosisteme, în Peru se găsesc 500 de specii de mamifere, inclusiv puma, jaguari, urși spectaculoși, maimuțe galbene, lămâi, alpacuri și vicuni. la mamifere, Peru are 1800 de specii de păsări și 300 de specii de reptile.
Din cele 500 de specii de mamifere din Peru, 70 sunt endemice și aproape 100 sunt amenințate sau pe cale de dispariție. Printre speciile endemice rare se numără jaguarul, ursul spectaculos și maimuța lăcustă galbenă.
Pădurea tropicală din Peru face parte din pădurea tropicală din Amazon, care găzduiește numeroase specii rare de păsări, reptile și mamifere care nu se găsesc în altă parte. Pe coasta Pacificului din Peru, multe specii s-au adaptat pentru a trăi într-un climat uscat al deșertului. Apele de coastă din Pacific susțin viața vastă a peștilor și a păsărilor marine, inclusiv pinguinul Humboldt. Peru este, de asemenea, cunoscut pentru munții săi. Acești munți susțin creșterea multor ierburi și plante care servesc ca hrană pentru lămâie, alpac și vicunas. Mamiferele care trăiesc în Peru s-au adaptat pentru a trăi în altitudini mari.În 2007, oamenii de știință au descoperit o nouă specie de rozătoare forestieră în Peru. Este strâns legată de șobolanul spinal. Începând cu 2014, oamenii de știință continuă să descopere specii noi în diversele ecosisteme ale Peru.
