Aligatorul prezintă multe adaptări, inclusiv pielea camuflată, degetele de la picioare, coada mare și ochii și nările bine plasate. Maxilele musculare și dinții ascuțiți permit aligatorului să prindă prada și să distrugă carnea .
Aligatorul este adaptat pentru a trăi în apă cu coada mare și degetele de la picioare. Coada este plată și funcționează la fel ca un vâsc, care o propulsează rapid prin apă. Parțială cu picioarele de pe picioare îi ajută să meargă în zonele noroioase fără a se scufunda. Ghearele puternice au numeroase utilizări, cum ar fi ajutarea aligatorului să creeze cuiburi.
Aligatorul are atât ochi, cât și nări care se află pe cap. În acest fel, aligatorul poate rămâne aproape scufundat în apă, în timp ce încă mai este capabil să respire. Mai mult, aceasta ascunde aligatorul din punctul de vedere al posibilei pradă. Chiar și părțile reptilelor care sunt deasupra apei sunt acoperite cu butoane și bulgări care fac aligatorul să pară o bucată de vegetație inofensivă.
Când aligatorul se scufundă complet, o membrană protectoare acoperă ochii, astfel încât să poată vedea sub apă. De asemenea, își poate închide urechile. Aligatorul are o structură specială care se închide peste trahee și păstrează plămânii fără apă atunci când scufundă.