Unele dintre cele mai importante forme de relief găsite în Honduras includ platoul interior ridicat al dealurilor și al munților, zonele joase ale Pacificului și zonele joase ale Caraibelor. Clima variază de la temperat în munți până la tropic în zonele joase. Un sistem extins de râuri străbate munții Sierra Madre, iar dealurile interioare și văile largi și fertile se găsesc în această regiune.
Coborârile din Caraibe sunt pline de plaje nisipoase și se întind de-a lungul coastei de nord. Această regiune conține Coasta de țânțari, o zonă nelocuită de junglă, lagune și mlaștini de mangrove. Zonele joase ale Pacificului sunt considerabil mai mici și înconjoară Golful Fonesca, în care se găsesc câteva insule inactive la vulcan. Această zonă joasă devine mlaștină în apropierea coastei. În ansamblu, Honduras este o țară bogată în apă, cu hidroenergetică considerată una dintre resursele sale naturale. Există doar un lac semnificativ numit Lacul Yojoa, dar există multe râuri importante.
Regiunea montană montană găzduiește majoritatea populației din Honduras și reprezintă 80% din suprafața sa totală. Numeroase văi cu fund plat se găsesc aici cu satele, orașele și capitala țării, Tegucigalpa, situate pe cele mai mari. Terenul din această regiune este în mare parte dificil de traversat și nu este potrivit pentru cultivare din cauza terenului accidentat. Calitatea solului este de asemenea slabă. O depresiune convenabilă și proeminentă se desfășoară în întreaga țară prin regiunea montană și oferă un traseu relativ ușor de transport între coastele nordică și sudică.
