Rio Negro, râul Jurua și râul Madeira sunt principalii afluenți ai râului Amazon. Există mai mult de 17 corpuri principale de apă care interacționează într-un fel sau altul cu râul Amazon.
Râul Amazon se întinde pe mai mult de 4.000 de mile și conține aproape 1.100 de afluenți, alții mult mai mici decât alții. Rio Negro este unul dintre cele mai mari și în ceea ce privește fluxul de apă, acesta deține recordul celui de-al doilea mare fluviu din lume. În unele dintre cele mai adânci locuri, acest râu are o înălțime de 300 de picioare, iar gura râului se află în Manaus, Brazilia. Jurua și Madeira sunt alți afluenți principali, care au lungimi mai mari de 2.000 de kilometri.
Unii dintre ceilalți mari afluenți ai Amazonului sunt râurile Japura, Purus și Xingu. Toate aceste râuri au o lungime de cel puțin 1000 de kilometri.
Înainte de dezvoltarea drumurilor moderne și a altor infrastructuri dezvoltate, afluenții erau principalele treceri pentru a ajunge în diferite zone ale Americii de Sud. Acești afluenți au permis mărfurilor să fie aduse și scoase din țările de pe continent.
Bazinul râului Amazon vede o medie de peste 7 metri de ploaie pe an, dar unele părți ale râului pot primi mai mult de 20 de picioare de ploaie pe parcursul unei perioade de 1 an.
