Unele dintre cele mai populare personaje Pokémon includ Pikachu, Mewtwo, Squirtle, Charmander și Bulbasaur. Aceste Pokémon se numără printre fanii și sunt toate prezentate în filmele și emisiunile de televiziune ale francizei.
Cu ușurință cel mai iconic personaj din serie, Pikachu este pilotul Pokémon și mascota originală a francizei. Mica rozătoare electrică este inseparabilă de Pokémon în sine și este una dintre singurele personaje care poate fi recunoscută și de cei care nu cunosc seria. În timp ce fanii hardcore nu-și pot aprecia supraviețuirea, nu există nici o denigrare a popularității lui Pikachu.
Cel mai rar și mai puternic Pokémon din incarnările originale ale "roșu" și "albastru" ale seriei, popularitatea lui Metwo a fost asigurată de la începutul francizei. Un puternic Pokémon psihic, Mewtwo, este ascuns adânc în Temnita Necunoscută, o zonă care devine accesibilă numai după ce jucătorii au terminat restul jocului. Revelația lui Mewtwo a condus la apariții în alte media, inclusiv primul film Pokémon și jocul popular de lupte "Super Smash Bros" al Nintendo.Jucătorii încep versiunea originală a Pokémonului, alegând una dintre cele trei Pokémon de bază: Bulbasaur, Squirtle sau Charmander. Reprezentând trei dintre cele mai importante tipuri de elemente de serie, fie iarbă, apă sau foc, inițialul "starter" Pokemon evoluează în unele dintre cele mai puternice creaturi din joc. Istoria lor, utilitatea și aparițiile proeminente din seria originală de televiziune Pokémon fac din Bulbasaur, Squirtle și Charmander trei dintre cele mai populare Pokémon din lume.