Factorii abiotici sunt părțile ne-vii ale unui ecosistem. Factorii abiotici ai Antarcticii sunt temperaturile sale scăzute, cantitatea mică de precipitații și foaia de gheață polară. Factorii abiotici lucrează cu factorii biotici sau vii pentru a modela ecosistemul.
Antarctica este un deșert polar. El primește mai puțin de 50 milimetri de precipitații pe an, iar umiditatea relativă scade până la 0,03 procente. Antarctica își păstrează acoperirea cu gheață în aceste condiții deoarece foarte puțin din zăpadă și gheață se topesc sau se sublimează. În schimb, acesta continuă să se acumuleze în timp, formând foaia de gheață groasă.
În plus față de habitatele sale oceane și foi de gheață, Antarctica are un ecosistem prosper de lacuri subacvatice. Aceste lacuri sunt protejate de frig prin foaia de gheață și nu au fost expuse la lumina soarelui sau la aer liber timp de cel puțin 120.000 de ani. Unele estimări științifice își pun formația încă de la un milion de ani. Aceste lacuri formează cel mai mare ecosistem neexplorat din lume, acoperind 9% din suprafața pământului.
Archaea și bacteriile sunt confirmate pentru a trăi în aceste lacuri, și condițiile sunt ipoteze pentru a sprijini antists. Există posibilitatea ca viermii mici și artropodii să supraviețuiască în acest ecosistem, dar alimentarea cu alimente disponibilă în lacuri nu ar susține organisme mai mari.
