Sistemele de recunoaștere a caracterelor cu cerneală magnetică oferă niveluri ridicate de securitate, deoarece caracterele MICR sunt scrise cu cerneală de oxid de fier și urmează un format strict, ceea ce face practic imposibilă forjarea; cu toate acestea, aceste sisteme specializate sunt costisitoare și pot fi utilizate numai pentru citirea fonturilor MICR scrise în anumite formate. Cartușele folosite în imprimantele MICR sunt, de asemenea, mai costisitoare în comparație cu alte cartușe de toner.
Un alt avantaj cheie al recunoașterii caracterului de cerneală magnetică este faptul că are o rată mică de eroare la citire. Scanerele MICR sunt dezvoltate pentru a descifra cu desăvârșire personajele, atâta timp cât respectă standardele stabilite de Asociația Americană a Bancilor, ABA și Institutul Național American de Standardizare, ANSI.
Aceste standarde sunt destul de ridicate și pot fi dificil de realizat, ceea ce poate constitui un dezavantaj distinct pentru unele instituții. ANSI gestionează și implementează toate standardele de imprimare; dacă fonturile MICR nu respectă standardele stabilite, acestea vor cauza erori de procesare și vor fi respinse la bănci și alte instituții.
Tehnologia de recunoaștere a caracterelor cu cerneală magnetică este folosită în cea mai mare parte de bănci pentru a verifica validitatea verificărilor; unele companii aeriene le utilizează pentru a valida biletele de avion. Caracterele și numerele sunt de obicei găsite în partea de jos a controalelor. Imprimantele laser care utilizează tonere MICR sunt utilizate pentru imprimarea caracterelor de cerneală magnetică.